Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf3Q920N1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Odf3Q920N1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms