Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FdpsQ920E5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FdpsQ920E5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FdpsQ920E5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms