Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smarca5Q91ZW3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smarca5Q91ZW3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smarca5Q91ZW3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smarca5Q91ZW3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms