Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp3Q91W36 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp3Q91W36 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp3Q91W36 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms