Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam20bQ8VCS3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam20bQ8VCS3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam20bQ8VCS3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam20bQ8VCS3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam20bQ8VCS3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fam20bQ8VCS3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms