Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gle1Q8R322 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gle1Q8R322 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gle1Q8R322 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms