Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim29Q8R2Q0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim29Q8R2Q0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim29Q8R2Q0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms