Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Rnf183Q8QZS5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf183Q8QZS5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Rnf183Q8QZS5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf183Q8QZS5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf183Q8QZS5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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