Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf183Q8QZS5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf183Q8QZS5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf183Q8QZS5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf183Q8QZS5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf183Q8QZS5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rnf183Q8QZS5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf183Q8QZS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms