Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Rdh16f2Q8K3M1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rdh16f2Q8K3M1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Rdh16f2Q8K3M1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Rdh16f2Q8K3M1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Rdh16f2Q8K3M1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Rdh16f2Q8K3M1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rdh16f2Q8K3M1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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