Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf39Q8K2Z2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf39Q8K2Z2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf39Q8K2Z2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf39Q8K2Z2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms