Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X8

Gtf2h5, General transcription factor IIH subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h5Q8K2X8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2h5Q8K2X8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2h5Q8K2X8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2h5Q8K2X8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms