Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pms1Q8K119 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pms1Q8K119 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pms1Q8K119 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pms1Q8K119 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms