Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syn3Q8JZP2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syn3Q8JZP2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syn3Q8JZP2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms