Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdkl1Q8CEQ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms