Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc178Q8CDV0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Ccdc178Q8CDV0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc178Q8CDV0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc178Q8CDV0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms