Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc38Q8CDN8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc38Q8CDN8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms