Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nhlrc3Q8CCH2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms