Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ift57Q8BXG3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ift57Q8BXG3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ift57Q8BXG3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms