Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMZ5

Tsen34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen34Q8BMZ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tsen34Q8BMZ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tsen34Q8BMZ5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsen34Q8BMZ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms