Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc2Q8BKV1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpc2Q8BKV1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc2Q8BKV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms