Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prune1Q8BIW1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prune1Q8BIW1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prune1Q8BIW1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms