Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg4cQ811C2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atg4cQ811C2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4cQ811C2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4cQ811C2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms