Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab3gap1Q80UJ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rab3gap1Q80UJ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms