Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sdccag8Q80UF4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdccag8Q80UF4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdccag8Q80UF4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms