Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccp110Q7TSH4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccp110Q7TSH4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccp110Q7TSH4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccp110Q7TSH4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms