Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf250Q7TNU6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf250Q7TNU6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf250Q7TNU6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms