Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssh1Q76I79 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssh1Q76I79 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssh1Q76I79 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms