Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl35Q6ZWV7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl35Q6ZWV7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms