Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube2oQ6ZPJ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube2oQ6ZPJ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube2oQ6ZPJ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms