Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scaf4Q6PFF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scaf4Q6PFF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scaf4Q6PFF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms