Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SvoplQ6PDF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SvoplQ6PDF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SvoplQ6PDF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms