Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hdac10Q6P3E7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hdac10Q6P3E7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac10Q6P3E7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac10Q6P3E7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms