Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sp140Q6NSQ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sp140Q6NSQ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp140Q6NSQ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms