Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q6DFW0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q6DFW0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6DFW0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6DFW0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q6DFW0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6DFW0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6DFW0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q6DFW0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q6DFW0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q6DFW0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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