Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl2Q69ZF8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl2Q69ZF8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Msl2Q69ZF8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl2Q69ZF8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl2Q69ZF8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl2Q69ZF8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl2Q69ZF8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl2Q69ZF8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl2Q69ZF8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms