Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sbno1Q689Z5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sbno1Q689Z5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbno1Q689Z5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sbno1Q689Z5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms