Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ino80dQ66JY2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ino80dQ66JY2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ino80dQ66JY2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.5 ms