Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q66JV7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q66JV7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q66JV7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q66JV7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q66JV7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q66JV7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q66JV7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q66JV7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q66JV7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q66JV7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q66JV7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q66JV7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q66JV7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q66JV7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q66JV7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q66JV7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q66JV7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q66JV7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q66JV7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q66JV7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q66JV7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q66JV7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q66JV7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q66JV7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q66JV7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q66JV7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q66JV7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q66JV7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q66JV7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q66JV7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q66JV7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q66JV7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q66JV7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q66JV7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q66JV7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q66JV7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q66JV7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q66JV7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q66JV7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q66JV7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q66JV7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q66JV7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q66JV7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q66JV7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q66JV7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q66JV7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q66JV7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q66JV7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q66JV7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Q66JV7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q66JV7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q66JV7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q66JV7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q66JV7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q66JV7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q66JV7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q66JV7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q66JV7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q66JV7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q66JV7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q66JV7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q66JV7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms