Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20854Q62461 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Gm20854Q62461 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm20854Q62461 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20854Q62461 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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