Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp1Q62442 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vamp1Q62442 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp1Q62442 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms