Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Sos1Q62245 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sos1Q62245 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sos1Q62245 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sos1Q62245 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sos1Q62245 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sos1Q62245 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sos1Q62245 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sos1Q62245 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sos1Q62245 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sos1Q62245 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sos1Q62245 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sos1Q62245 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sos1Q62245 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Sos1Q62245 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sos1Q62245 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sos1Q62245 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sos1Q62245 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sos1Q62245 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sos1Q62245 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sos1Q62245 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sos1Q62245 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sos1Q62245 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sos1Q62245 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Sos1Q62245 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sos1Q62245 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sos1Q62245 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sos1Q62245 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sos1Q62245 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sos1Q62245 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sos1Q62245 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sos1Q62245 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms