Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsg1aQ61495 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsg1aQ61495 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dsg1aQ61495 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms