Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctnna2Q61301 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctnna2Q61301 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms