Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Irf9Q61179 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Irf9Q61179 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Irf9Q61179 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irf9Q61179 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms