Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trpc6Q61143 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpc6Q61143 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpc6Q61143 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpc6Q61143 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms