Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CybbQ61093 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CybbQ61093 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CybbQ61093 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CybbQ61093 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CybbQ61093 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CybbQ61093 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CybbQ61093 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CybbQ61093 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CybbQ61093 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CybbQ61093 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms