Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HarsQ61035 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HarsQ61035 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HarsQ61035 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HarsQ61035 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HarsQ61035 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HarsQ61035 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms