Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
JrkQ60976 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JrkQ60976 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
JrkQ60976 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JrkQ60976 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
JrkQ60976 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
JrkQ60976 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
JrkQ60976 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
JrkQ60976 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms