Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp4Q60972 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp4Q60972 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rbbp4Q60972 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms