Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkn2cQ60772 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkn2cQ60772 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkn2cQ60772 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms